Rejecting a tool call auto-rejects all future MCP tool calls

[williammartin]

Describe the bug

If a tool call is rejected on the permission request dialog, all future MCP tool calls become auto rejected.

Affected version

0.0.340-4 Commit: acb943f

Steps to reproduce the behavior

 Welcome to GitHub Copilot CLI
 Version 0.0.1

 Copilot can write, test and debug code right from your terminal. Describe a task to get started or enter ? for help. Copilot uses AI, check for mistakes.

 ● Connected to GitHub MCP Server

 ● Logged in as user: williammartin

 ╭───────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╮
 │ > Sleep for 10s                                                                                                                                                                                                                       │
 ╰───────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╯

 ● I'll sleep for 10 seconds.

 ✗ Sleep for 10 seconds
   $ sleep 10
   Rejected by you.

 ● Operation cancelled by user

 ╭───────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╮
 │ > List the 10 most recent issues on cli/cli                                                                                                                                                                                           │
 ╰───────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╯

 ✗ List issues
   Rejected by you.

 ~/workspace/github/sweagentd/runtime[⎇ 6927-detect-all-orphaned-tool-calls]                                                                                                                                            claude-sonnet-4.5
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 >  Enter @ to mention files or / for commands
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 Ctrl+c Exit · Ctrl+r Expand recent

Expected behavior

No response

Additional context

No response